“与本案无牵连”，即与犯罪嫌疑人、被告人所涉嫌的案件没有任何牵扯，即保证人不能是本案的同案犯，也不能是本案的证人，否则，因其本身也是司法机关调查的对象，就难以保证其认真履行保证义务。
适用的目的不尽相同

保证合同适用的惟一目的是担保债权的实现，除此无任何存在价值。而保证保险合同作为一种保险手段，则是以降低违约风险和分散风险为目的。

运行方式不同

保证合同以担保主债为目的，其内容体现的是依附被担保的主债，而不追求任何经济利益为目的。保证保险合同是一种财产保险合同，是当事人之间的一种商品交换关系，保险人通过开展保险业务化解和分散商业风险，换取商业利润。
《关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》：“主债务诉讼时效期间届满，保证人享有主债务人的诉讼时效抗辩权。”根据上述规定，主债权人想达到让保证人承担保证合同债务的目的，除了要在保证期间内行使权利外，还要在主债务诉讼时效期间内行使权利。如果主债务已过诉讼时效，既使还在保证期间内，保证人也可以因主债务诉讼时效已过而免除保证责任。
在日常生活中，保证期间由当事人在保证合同中约定，在没有约定(包括视为没有约定)和约定不明的情况下，法律规定了6个月和2年的保证期间，上述保证期间不超过主债务合同的诉讼时效期间，债权人只要在保证期间内行使法定权利，完全可以达到要求保证人承担保证合同债务的目的。
主体不同

保证保险合同的主体是债权人和保证人，其中对保证人的资格，除了法律禁止作保证人的情况以外，担保法未予以过多的限制，仅是一般性的规定了应具有代偿能力。保证保险合同的主体包括投保人、被保险人和保险人。其中，投保人和被保险人同时就是买卖合同(或者贷款合同)的买方(或借款方)和卖方(或贷款方)，保险一方必须是依据保险法取得经营保证保险业务的商业保险公司。
合同的内容不同

保证合同是典型的单务无偿合同，其内容由债权人的担保权利和保证人的保证义务构成。当主债务人不履行债务时，债权人有权要求保证人履行保证义务，保证人应当依约定履行所承担的保证义务。保证人除在一般保证中享有先诉抗辩权外，在保证合同中不享有任何权利。保证保险合同则是双务有偿合同，其内容主要是由投保人交纳保费的义务和保险人承担保险责任构成。


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